运行时主目录
Demiurge 是 local-first 的。Runtime 状态保存在 runtime home 下，通常是：
~/.demiurge
源代 码 checkout 和 runtime home 的职责不同。
主体布局
~/.demiurge/
config.yaml
.env
.core.git/
.core.lock
.evolve/
runs/
agents/
agent.yaml
assistant/
evolver/
runtime/
runtime.sqlite3
artifacts/
session-events/
workspace/
logs/
config.yaml 是 host-owned 的 runtime 配置。.env 可以保存本地 provider
密钥。.core.git/ 是 runtime agents tree 的 bare Git repository，agents/
是该 tree 的 live checkout。.evolve/ 保存隔离 change-set worktrees。runtime/
包含 SQLite control-plane database、delivery outbox projection、scheduler runtime
projections、session event logs 和 host-owned artifacts。workspace/ 是非本地的
fallback workspace。
源模板与 Runtime Core
仓库中的源模板位于：
agents/
在 fresh runtime home 上，demiurge init 会把这棵 tree commit 到：
~/.demiurge/.core.git
并把 live agents tree checkout 到：
~/.demiurge/agents/
如果要修改本地行为，就编辑 runtime cores。只有在你要修改默认打包项目行为时，才编辑
源模板。此版本不迁移 legacy runtime homes；如果旧版本创建过 ~/.demiurge，首次运行
前应删除旧 runtime home。
Local Agent Edits
你可以直接编辑 ~/.demiurge/agents/ 下的文件。Demiurge 会把这些 changes 当作
local agent edits，并在明确的 workflow 边界保存为 Git-backed core revisions。
run/edit workflows、package install/uninstall、setup model set 和 evolve start
会先验证并保存 local agent edits，然后继续执行。这个保存会成为独立 commit，不会和
package、setup 或 evolve transaction 混在同一个 revision 里。
core status、core diff、package preview 和 package list 这类只读命令不会保存或丢弃
任何内容。evolve promote 和 rollback 这类 revision switch 命令如果发现仍有 local
agent edits，会拒绝切换，因为切换可能覆盖或遗留这些文件。
需要手动管理 edits 时使用：
uv run demiurge core diff
uv run demiurge core save
uv run demiurge core discard --yes
托管 Checkout
Managed install 会把 checkout 放在：
~/.demiurge/demiurge-agent
Live runtime cores 仍然是独立 Git revisions，所以更新 managed checkout 不会覆盖已经 编辑过的 Agent Core。
漂移
在刷新 runtime 文件之前，先做只读 drift 检查：
uv run demiurge init --check
uv run demiurge doctor
有意刷新时。Refresh 是一个 Git transaction，会从 source templates 创建新的 live revision：
uv run demiurge init --refresh assistant
检查 live repository：
uv run demiurge core status
uv run demiurge core versions
uv run demiurge core check